Aji

最近在处理小鼠全脑的单细胞数据，归纳总结下细胞类型鉴定的过程吧。我用的算法是Seurat label transfer function[https://satijalab....

没有眼镜

1.加载数据 直接加载之前的obj.Rdata 2.计算makergene 和差异基因里面的上调基因有点类似，某个基因在某一簇细胞里表达量都很高，在其他簇表达量很低，那么这个...

吕强强学生信

一.RepeatMasker简介: 基因组组装完成后，进行基因预测和注释。由于基因组中存在重复序列结构区，特别是高等真核生物，重复序列占了相当大的比例，会影响基因预测的质量，...

生信石头

简介[#toc_0] Mamba是在c++中对conda的重新实现,可以认为是更高级的conda。有以下特点使用多线程并行下载数据和package，实现更高效的安装libso...

努力学习的消炎药

首先可以直接大小写转换： 但是这样还是存在很多例如 TP53 和 小鼠的Trp53直接转换后不对应的问题。于是考虑到要同源转换。但是看了很多教程，看完了还是干着急不能用...

Seurat_Satija

我们知道小鼠是一个研究很多的模式生物，有很多生物学研究，以及一些临床研究都是在小鼠上做的。那么小鼠里面研究的这个基因在人里面有没有，对应的具体又是一个什么基因，这是我们经常需...

笺牒九州的怪咖

GREAT是一款peak区间进行基因注释的工具，除了给出peak对应的基因外，还集成了多种基因的功能分析，网址如下 http://great.stanford.edu/pub...