40篇文章 · 26450字 · 5人关注
-
2025-05-02 | GWAS分析-包含LD信息的Locuszoom图的绘制在进行GWAS分析之后呢，我们通常会通过LD clumpping得到lead SNP，然而这些lead SNP在基因组中会与其他SNP有比较强烈...
-
组会论文 | Nat Genet：大规模多性状全基因组关联分析鉴定数百个青光眼风险位点《Large-scale multitrait genome-wide association analyses identify hundre...
-
2024-11-30 | 群体遗传变异——SNP及INDEL calling进行群体遗传学分析的前提是我们得得到变异信息，之前已经介绍了如何进行CNV的识别，那么本文来介绍下如何识别基因组中分布更多、更常见的变异SNP（...
-
2024-10-16 | GWAS数据SNP rsID的注释
当我们拿到某个研究的GWAS summary data时，因为大多是二代测序的缘故，它的SNP ID可能不是正常的rsid，但是，我们下游有些分...
-
2024-09-05 | ggplot绘制曼哈顿图----受够了有些包的自定义限制整体脚本如下，需要你的文件包含CHR BP P三列，无所谓顺序，也无所谓有啥其他列，只要有这三列即可 结果如下
-
2024-08-31 | mwget----wget的升级版，超快的下载工具
mwget，m就是multi多线程的意思。mwget是wget的升级版，支持多线程下载，且默认为短点续传。 1、软件安装 当然，我是推荐直接在g...
-
2024-05-11 | 记录
道心崩碎，先沉寂一段时间
-
2024-04-11 | Jupyter Book & Github Pages--撰写网页书
在我们学习某些东西的时候，经常会用pdf、markdown文件或者ipynb文件等去记录一些分析过程，但是如果文件比较多并且比较长的时候，后面查...
-
2024-04-09 | ggplot各种图展示最近在学习R，在这里介绍下ggplot绘制的各种图形及代码，还是非常好用的 1 数据 用的数据是R中自带的mpg数据集，长这样（部分） manu...
文集作者
