发简信
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简书答疑公告
其实我转移到了别的平台，简书很久才看一次，评论看到的时候基本已经过去很多天，另外平时工作繁忙，很少有功夫回复。如果是跟我的教程学习，有卡住的情况...
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R语言取整和四舍五入函数汇总
在数据分析时，经常需要对数字进行取整或者四舍五入。R 语言里有几个常用的相关函数：ceiling()、floor()、trunc()、round...
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聊一聊TCGA那些生存期一点背景知识 其实生存分析不只有总生存期，TCGA可以很方便的分析的有： OS (Overall Survival) 总生存期: 0 = 患者存...
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有的难度是想象出来的，这样这样再这样不就解决啦！1.问题数据 学员遇到一个有问题的基因表达芯片数据： 可以看到这个数据有两个问题：数值大小都在0附近，里面还有NA 2.探索原因 在GSE页面上...
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百万级别的单细胞数据是怎样完成注释的（R）1.背景知识 细胞数量太大时，单纯的一次降维聚类分群是无法搞定的，所以需要二次分群然后把注释的结果重新放回原来的对象中。 2.加载数据 sce....
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python版的singler单细胞注释工具网上可以搜到大量的R语言singleR的代码和教程，但python版的就比较少啦，恭喜你找到了我。 1.文件读取 输入的数据是10X标准的三个文...
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gseapy-python版的富集分析本文比较长，长到需要一个目录ORA1.输入数据之基因2.输入数据之基因集合2.1 可以是预设的基因集合名称2.2 可以是来自msigdb网站的g...
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python单细胞数据的基因集打分1.R包和数据准备 随便一个h5文件即可。我这里使用的是pbmc3k，scanpy推文最后生成的文件就是它。 2.获取用于评分的基因集合 基本上...
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